Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
DDR1Q08345 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDR1Q08345 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms