Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTN3Q08043 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms