Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR3Q06889 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms