Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG1Q06432 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms