Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEUP1Q05D60 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEUP1Q05D60 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms