Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EGR4Q05215 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR4Q05215 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms