Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EMX2Q04743 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMX2Q04743 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms