Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 RTT106YNL206C 1368 nt5.63□□□□□ -1.51
SND1Q04007 PHO12YHR215W 1404 nt5.63□□□□□ -1.51
SND1Q04007 PHO11YAR071W 1404 nt5.63□□□□□ -1.51
SND1Q04007 GAS5YOL030W 1455 nt5.63□□□□□ -1.51
SND1Q04007 RAD53YPL153C 2466 nt5.63□□□□□ -1.51
SND1Q04007 CAB3YKL088W 1716 nt5.62□□□□□ -1.51
SND1Q04007 BAP2YBR068C 1830 nt5.62□□□□□ -1.51
SND1Q04007 PRM7YDL039C 2097 nt5.62□□□□□ -1.51
SND1Q04007 APL6YGR261C 2430 nt5.62□□□□□ -1.51
SND1Q04007 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.62□□□□□ -1.51
SND1Q04007 YBR219CYBR219C 384 nt5.62□□□□□ -1.51
SND1Q04007 MOT2YER068W 1764 nt5.62□□□□□ -1.51
SND1Q04007 RIM101YHL027W 1878 nt5.62□□□□□ -1.51
SND1Q04007 YFL034WYFL034W 3222 nt5.61□□□□□ -1.51
SND1Q04007 RAD7YJR052W 1698 nt5.61□□□□□ -1.51
SND1Q04007 DPH2YKL191W 1605 nt5.61□□□□□ -1.51
SND1Q04007 COS9YKL219W 1224 nt5.61□□□□□ -1.51
SND1Q04007 MDL1YLR188W 2088 nt5.61□□□□□ -1.51
SND1Q04007 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt5.61□□□□□ -1.51
SND1Q04007 UBC4YBR082C 447 nt5.61□□□□□ -1.51
SND1Q04007 OCT1YKL134C 2319 nt5.6□□□□□ -1.51
SND1Q04007 UTP18YJL069C 1785 nt5.6□□□□□ -1.51
SND1Q04007 GEP3YOR205C 1671 nt5.6□□□□□ -1.51
SND1Q04007 KTR7YIL085C 1554 nt5.6□□□□□ -1.51
SND1Q04007 BUD30YDL151C 582 nt5.6□□□□□ -1.51
SND1Q04007 YKL223WYKL223W 333 nt5.6□□□□□ -1.51
SND1Q04007 BLS1YLR408C 369 nt5.6□□□□□ -1.51
SND1Q04007 CTR3YLR411W 726 nt5.6□□□□□ -1.51
SND1Q04007 TIF34YMR146C 1044 nt5.6□□□□□ -1.51
SND1Q04007 NRM1YNR009W 750 nt5.6□□□□□ -1.51
SND1Q04007 YGL036WYGL036W 2730 nt5.6□□□□□ -1.51
SND1Q04007 GGA1YDR358W 1674 nt5.59□□□□□ -1.51
SND1Q04007 HFI1YPL254W 1467 nt5.59□□□□□ -1.51
SND1Q04007 ARP2YDL029W 1176 nt5.59□□□□□ -1.51
SND1Q04007 COS7YDL248W 1152 nt5.59□□□□□ -1.51
SND1Q04007 SYN8YAL014C 768 nt5.59□□□□□ -1.51
SND1Q04007 SFH5YJL145W 885 nt5.59□□□□□ -1.51
SND1Q04007 COS5YJR161C 1152 nt5.59□□□□□ -1.51
SND1Q04007 PHO90YJL198W 2646 nt5.59□□□□□ -1.52
SND1Q04007 TRP3YKL211C 1455 nt5.58□□□□□ -1.52
SND1Q04007 VTH1YIL173W 4650 nt5.58□□□□□ -1.52
SND1Q04007 VTH2YJL222W 4650 nt5.58□□□□□ -1.52
SND1Q04007 SCT1YBL011W 2280 nt5.58□□□□□ -1.52
SND1Q04007 MKS1YNL076W 1755 nt5.58□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YDL026WYDL026W 312 nt5.58□□□□□ -1.52
SND1Q04007 VCX1YDL128W 1236 nt5.58□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt5.58□□□□□ -1.52
SND1Q04007 SCW4YGR279C 1161 nt5.58□□□□□ -1.52
SND1Q04007 HSP150YJL159W 1242 nt5.58□□□□□ -1.52
SND1Q04007 CBC2YPL178W 627 nt5.58□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YPL191CYPL191C 1083 nt5.58□□□□□ -1.52
SND1Q04007 RFT1YBL020W 1725 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YHR045WYHR045W 1683 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 ALG9YNL219C 1668 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 CLP1YOR250C 1338 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 MTQ2YDR140W 666 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 HSP31YDR533C 714 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YIL060WYIL060W 435 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 RFC2YJR068W 1062 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YLR118CYLR118C 684 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 NMD4YLR363C 657 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 RRP40YOL142W 723 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 PDH1YPR002W 1551 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 MKK2YPL140C 1521 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 SNF3YDL194W 2655 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 KRS1YDR037W 1776 nt5.57□□□□□ -1.52
SND1Q04007 MCM6YGL201C 3054 nt5.56□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YMR1YJR110W 2067 nt5.56□□□□□ -1.52
SND1Q04007 TRM8YDL201W 861 nt5.56□□□□□ -1.52
SND1Q04007 RPB7YDR404C 516 nt5.56□□□□□ -1.52
SND1Q04007 IRC6YFR043C 714 nt5.56□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YLR346CYLR346C 306 nt5.56□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YBL044WYBL044W 369 nt5.56□□□□□ -1.52
SND1Q04007 CUS2YNL286W 858 nt5.56□□□□□ -1.52
SND1Q04007 MBP1YDL056W 2502 nt5.56□□□□□ -1.52
SND1Q04007 DED81YHR019C 1665 nt5.56□□□□□ -1.52
SND1Q04007 TIM54YJL054W 1437 nt5.56□□□□□ -1.52
SND1Q04007 ADE3YGR204W 2841 nt5.56□□□□□ -1.52
SND1Q04007 CWC21YDR482C 408 nt5.55□□□□□ -1.52
SND1Q04007 COS4YFL062W 1140 nt5.55□□□□□ -1.52
SND1Q04007 HPM1YIL110W 1134 nt5.55□□□□□ -1.52
SND1Q04007 MRPL13YKR006C 795 nt5.55□□□□□ -1.52
SND1Q04007 BUD14YAR014C 2130 nt5.55□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YLR194CYLR194C 765 nt5.55□□□□□ -1.52
SND1Q04007 COS3YML132W 1140 nt5.55□□□□□ -1.52
SND1Q04007 COS2YBR302C 1140 nt5.55□□□□□ -1.52
SND1Q04007 HSP104YLL026W 2727 nt5.55□□□□□ -1.52
SND1Q04007 SMF3YLR034C 1422 nt5.55□□□□□ -1.52
SND1Q04007 TAX4YJL083W 1815 nt5.54□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YGR079WYGR079W 1113 nt5.54□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YIL089WYIL089W 618 nt5.54□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YKL151CYKL151C 1014 nt5.54□□□□□ -1.52
SND1Q04007 SPC3YLR066W 555 nt5.54□□□□□ -1.52
SND1Q04007 URE2YNL229C 1065 nt5.54□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YEL077CYEL077C 3834 nt5.54□□□□□ -1.52
SND1Q04007 PUS9YDL036C 1389 nt5.54□□□□□ -1.52
SND1Q04007 LAP3YNL239W 1365 nt5.54□□□□□ -1.52
SND1Q04007 HEM3YDL205C 984 nt5.53□□□□□ -1.52
SND1Q04007 YDR053WYDR053W 396 nt5.53□□□□□ -1.52
SND1Q04007 MLC1YGL106W 450 nt5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms