Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ROM1Q03395 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms