Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV1Q03135 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms