Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSF1Q00613 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSF1Q00613 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms