Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD3P84022 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD3P84022 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD3P84022 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms