Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IRX6P78412 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IRX6P78412 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IRX6P78412 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IRX6P78412 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IRX6P78412 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IRX6P78412 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IRX6P78412 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IRX6P78412 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IRX6P78412 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IRX6P78412 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IRX6P78412 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IRX6P78412 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IRX6P78412 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX6P78412 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX6P78412 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX6P78412 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX6P78412 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX6P78412 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX6P78412 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX6P78412 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX6P78412 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX6P78412 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX6P78412 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX6P78412 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX6P78412 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IRX6P78412 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IRX6P78412 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IRX6P78412 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IRX6P78412 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
IRX6P78412 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
IRX6P78412 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX6P78412 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX6P78412 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX6P78412 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX6P78412 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX6P78412 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX6P78412 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX6P78412 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX6P78412 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX6P78412 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX6P78412 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX6P78412 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX6P78412 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX6P78412 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX6P78412 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX6P78412 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX6P78412 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX6P78412 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX6P78412 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX6P78412 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX6P78412 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX6P78412 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX6P78412 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX6P78412 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX6P78412 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX6P78412 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX6P78412 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX6P78412 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX6P78412 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX6P78412 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX6P78412 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX6P78412 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX6P78412 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX6P78412 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX6P78412 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRX6P78412 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRX6P78412 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRX6P78412 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRX6P78412 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRX6P78412 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
IRX6P78412 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRX6P78412 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRX6P78412 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRX6P78412 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRX6P78412 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRX6P78412 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRX6P78412 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRX6P78412 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX6P78412 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX6P78412 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX6P78412 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX6P78412 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX6P78412 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX6P78412 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX6P78412 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX6P78412 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX6P78412 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX6P78412 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX6P78412 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX6P78412 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX6P78412 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX6P78412 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX6P78412 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX6P78412 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX6P78412 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX6P78412 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX6P78412 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX6P78412 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX6P78412 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms