Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAE1P78406 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAE1P78406 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAE1P78406 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAE1P78406 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAE1P78406 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAE1P78406 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAE1P78406 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAE1P78406 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAE1P78406 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAE1P78406 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAE1P78406 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAE1P78406 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAE1P78406 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAE1P78406 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAE1P78406 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAE1P78406 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAE1P78406 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAE1P78406 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAE1P78406 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAE1P78406 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAE1P78406 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAE1P78406 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAE1P78406 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAE1P78406 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAE1P78406 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAE1P78406 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAE1P78406 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAE1P78406 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAE1P78406 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAE1P78406 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAE1P78406 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAE1P78406 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAE1P78406 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAE1P78406 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAE1P78406 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAE1P78406 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAE1P78406 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAE1P78406 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAE1P78406 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAE1P78406 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAE1P78406 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAE1P78406 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAE1P78406 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAE1P78406 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAE1P78406 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAE1P78406 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAE1P78406 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAE1P78406 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAE1P78406 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAE1P78406 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAE1P78406 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAE1P78406 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAE1P78406 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAE1P78406 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAE1P78406 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAE1P78406 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAE1P78406 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAE1P78406 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAE1P78406 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAE1P78406 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAE1P78406 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAE1P78406 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAE1P78406 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAE1P78406 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAE1P78406 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAE1P78406 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAE1P78406 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAE1P78406 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAE1P78406 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAE1P78406 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAE1P78406 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAE1P78406 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAE1P78406 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms