Protein–RNA interactions for Protein: P78358

CTAG1A, Cancer/testis antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1AP78358 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTAG1AP78358 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTAG1AP78358 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms