Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC1P78348 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms