Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1A1P68104 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P68104 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEF1A1P68104 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms