Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPNP63162 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPNP63162 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms