Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P62891 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL39P62891 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPL39P62891 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P62891 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P62891 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P62891 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P62891 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P62891 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P62891 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P62891 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL39P62891 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P62891 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P62891 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P62891 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P62891 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL39P62891 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P62891 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P62891 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P62891 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P62891 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P62891 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P62891 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P62891 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P62891 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P62891 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P62891 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P62891 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL39P62891 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P62891 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P62891 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P62891 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P62891 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P62891 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P62891 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P62891 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P62891 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL39P62891 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL39P62891 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL39P62891 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms