Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS28P62857 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS28P62857 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS28P62857 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS28P62857 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS28P62857 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS28P62857 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS28P62857 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS28P62857 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS28P62857 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS28P62857 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS28P62857 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS28P62857 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS28P62857 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RPS28P62857 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS28P62857 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS28P62857 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS28P62857 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS28P62857 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS28P62857 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS28P62857 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS28P62857 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS28P62857 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS28P62857 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS28P62857 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS28P62857 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS28P62857 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS28P62857 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS28P62857 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS28P62857 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS28P62857 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS28P62857 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS28P62857 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS28P62857 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS28P62857 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS28P62857 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS28P62857 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS28P62857 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS28P62857 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS28P62857 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS28P62857 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS28P62857 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS28P62857 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS28P62857 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS28P62857 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS28P62857 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS28P62857 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS28P62857 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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