Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS29P62273 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RPS29P62273 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPS29P62273 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RPS29P62273 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RPS29P62273 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RPS29P62273 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RPS29P62273 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RPS29P62273 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RPS29P62273 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RPS29P62273 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RPS29P62273 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RPS29P62273 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RPS29P62273 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RPS29P62273 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RPS29P62273 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPS29P62273 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPS29P62273 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPS29P62273 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RPS29P62273 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPS29P62273 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPS29P62273 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RPS29P62273 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RPS29P62273 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPS29P62273 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPS29P62273 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPS29P62273 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPS29P62273 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPS29P62273 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPS29P62273 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RPS29P62273 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPS29P62273 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPS29P62273 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPS29P62273 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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