Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP46P62068 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP46P62068 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP46P62068 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP46P62068 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP46P62068 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP46P62068 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP46P62068 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP46P62068 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP46P62068 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP46P62068 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP46P62068 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP46P62068 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP46P62068 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP46P62068 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP46P62068 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP46P62068 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP46P62068 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP46P62068 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP46P62068 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP46P62068 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP46P62068 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP46P62068 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP46P62068 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP46P62068 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP46P62068 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP46P62068 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP46P62068 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP46P62068 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP46P62068 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP46P62068 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP46P62068 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP46P62068 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP46P62068 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP46P62068 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP46P62068 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP46P62068 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP46P62068 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP46P62068 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP46P62068 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP46P62068 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP46P62068 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP46P62068 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP46P62068 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP46P62068 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP46P62068 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP46P62068 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP46P62068 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP46P62068 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP46P62068 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP46P62068 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP46P62068 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP46P62068 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP46P62068 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP46P62068 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP46P62068 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP46P62068 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP46P62068 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP46P62068 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP46P62068 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP46P62068 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP46P62068 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP46P62068 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP46P62068 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP46P62068 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP46P62068 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP46P62068 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP46P62068 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP46P62068 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP46P62068 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP46P62068 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP46P62068 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms