Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3EP60228 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3EP60228 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms