Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CABP4P57796 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CABP4P57796 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CABP4P57796 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CABP4P57796 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CABP4P57796 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CABP4P57796 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CABP4P57796 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CABP4P57796 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CABP4P57796 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CABP4P57796 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CABP4P57796 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CABP4P57796 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CABP4P57796 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CABP4P57796 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CABP4P57796 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CABP4P57796 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CABP4P57796 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CABP4P57796 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP4P57796 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP4P57796 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP4P57796 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP4P57796 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP4P57796 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP4P57796 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP4P57796 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP4P57796 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP4P57796 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP4P57796 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP4P57796 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP4P57796 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CABP4P57796 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP4P57796 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP4P57796 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP4P57796 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP4P57796 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP4P57796 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP4P57796 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CABP4P57796 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP4P57796 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP4P57796 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP4P57796 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP4P57796 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP4P57796 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP4P57796 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP4P57796 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP4P57796 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP4P57796 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP4P57796 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CABP4P57796 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP4P57796 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP4P57796 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP4P57796 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP4P57796 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP4P57796 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP4P57796 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP4P57796 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP4P57796 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP4P57796 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP4P57796 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP4P57796 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CABP4P57796 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP4P57796 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP4P57796 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP4P57796 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP4P57796 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP4P57796 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP4P57796 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP4P57796 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CABP4P57796 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CABP4P57796 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP4P57796 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP4P57796 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP4P57796 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP4P57796 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP4P57796 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP4P57796 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP4P57796 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP4P57796 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP4P57796 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP4P57796 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP4P57796 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP4P57796 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP4P57796 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP4P57796 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP4P57796 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP4P57796 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP4P57796 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP4P57796 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP4P57796 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP4P57796 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP4P57796 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP4P57796 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP4P57796 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP4P57796 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP4P57796 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP4P57796 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP4P57796 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP4P57796 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP4P57796 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms