Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EEFSECP57772 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms