Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN2P57739 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN2P57739 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN2P57739 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms