Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF3P57682 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF3P57682 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF3P57682 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF3P57682 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF3P57682 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF3P57682 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF3P57682 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF3P57682 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF3P57682 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF3P57682 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF3P57682 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF3P57682 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF3P57682 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF3P57682 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF3P57682 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF3P57682 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF3P57682 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF3P57682 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF3P57682 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF3P57682 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF3P57682 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF3P57682 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF3P57682 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF3P57682 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF3P57682 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF3P57682 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF3P57682 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF3P57682 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF3P57682 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF3P57682 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLF3P57682 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF3P57682 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF3P57682 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF3P57682 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF3P57682 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF3P57682 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF3P57682 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF3P57682 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF3P57682 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF3P57682 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF3P57682 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF3P57682 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF3P57682 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF3P57682 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF3P57682 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF3P57682 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF3P57682 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF3P57682 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF3P57682 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF3P57682 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF3P57682 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF3P57682 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF3P57682 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF3P57682 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF3P57682 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF3P57682 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF3P57682 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF3P57682 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF3P57682 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms