Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NME5P56597 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME5P56597 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME5P56597 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME5P56597 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME5P56597 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME5P56597 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME5P56597 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME5P56597 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NME5P56597 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
NME5P56597 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME5P56597 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME5P56597 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME5P56597 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME5P56597 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME5P56597 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME5P56597 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME5P56597 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME5P56597 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME5P56597 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME5P56597 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME5P56597 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME5P56597 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME5P56597 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NME5P56597 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME5P56597 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME5P56597 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME5P56597 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME5P56597 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NME5P56597 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME5P56597 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME5P56597 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME5P56597 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME5P56597 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NME5P56597 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME5P56597 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME5P56597 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME5P56597 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME5P56597 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME5P56597 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME5P56597 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME5P56597 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NME5P56597 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME5P56597 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME5P56597 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME5P56597 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NME5P56597 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME5P56597 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME5P56597 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME5P56597 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME5P56597 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME5P56597 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME5P56597 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME5P56597 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME5P56597 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME5P56597 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME5P56597 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME5P56597 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME5P56597 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME5P56597 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME5P56597 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME5P56597 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME5P56597 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME5P56597 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME5P56597 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME5P56597 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms