Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP7P55210 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP7P55210 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP7P55210 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASP7P55210 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP7P55210 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP7P55210 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP7P55210 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP7P55210 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP7P55210 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP7P55210 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP7P55210 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP7P55210 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP7P55210 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP7P55210 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP7P55210 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP7P55210 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP7P55210 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP7P55210 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP7P55210 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP7P55210 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP7P55210 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP7P55210 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP7P55210 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP7P55210 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP7P55210 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP7P55210 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP7P55210 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP7P55210 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP7P55210 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP7P55210 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP7P55210 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP7P55210 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP7P55210 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP7P55210 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP7P55210 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP7P55210 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP7P55210 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP7P55210 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP7P55210 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CASP7P55210 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP7P55210 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP7P55210 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP7P55210 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP7P55210 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP7P55210 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP7P55210 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP7P55210 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP7P55210 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASP7P55210 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASP7P55210 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASP7P55210 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP7P55210 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP7P55210 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP7P55210 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP7P55210 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP7P55210 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP7P55210 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASP7P55210 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASP7P55210 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP7P55210 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP7P55210 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP7P55210 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP7P55210 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP7P55210 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP7P55210 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP7P55210 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP7P55210 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP7P55210 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP7P55210 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP7P55210 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP7P55210 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CASP7P55210 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CASP7P55210 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP7P55210 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP7P55210 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP7P55210 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP7P55210 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP7P55210 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP7P55210 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP7P55210 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CASP7P55210 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASP7P55210 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASP7P55210 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASP7P55210 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP7P55210 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP7P55210 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP7P55210 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP7P55210 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP7P55210 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP7P55210 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP7P55210 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP7P55210 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP7P55210 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP7P55210 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP7P55210 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP7P55210 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP7P55210 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP7P55210 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP7P55210 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms