Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB3P54753 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHB3P54753 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms