Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATN1P54259 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATN1P54259 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATN1P54259 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATN1P54259 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATN1P54259 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATN1P54259 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATN1P54259 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATN1P54259 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATN1P54259 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATN1P54259 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATN1P54259 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATN1P54259 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATN1P54259 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATN1P54259 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATN1P54259 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATN1P54259 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATN1P54259 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATN1P54259 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATN1P54259 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATN1P54259 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATN1P54259 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATN1P54259 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATN1P54259 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATN1P54259 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATN1P54259 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATN1P54259 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATN1P54259 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATN1P54259 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATN1P54259 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATN1P54259 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATN1P54259 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATN1P54259 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATN1P54259 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATN1P54259 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATN1P54259 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATN1P54259 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATN1P54259 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATN1P54259 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATN1P54259 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATN1P54259 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATN1P54259 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATN1P54259 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATN1P54259 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATN1P54259 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATN1P54259 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATN1P54259 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATN1P54259 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATN1P54259 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATN1P54259 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATN1P54259 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATN1P54259 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATN1P54259 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATN1P54259 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATN1P54259 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATN1P54259 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATN1P54259 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATN1P54259 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATN1P54259 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATN1P54259 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATN1P54259 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATN1P54259 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATN1P54259 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATN1P54259 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATN1P54259 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATN1P54259 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATN1P54259 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATN1P54259 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATN1P54259 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATN1P54259 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATN1P54259 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATN1P54259 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATN1P54259 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATN1P54259 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATN1P54259 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATN1P54259 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATN1P54259 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATN1P54259 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATN1P54259 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATN1P54259 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATN1P54259 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATN1P54259 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATN1P54259 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATN1P54259 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATN1P54259 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATN1P54259 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms