Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATXN1P54253 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms