Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRAP54198 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRAP54198 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRAP54198 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HIRAP54198 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRAP54198 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRAP54198 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRAP54198 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRAP54198 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRAP54198 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRAP54198 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRAP54198 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HIRAP54198 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRAP54198 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRAP54198 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRAP54198 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRAP54198 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRAP54198 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRAP54198 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRAP54198 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRAP54198 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRAP54198 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HIRAP54198 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRAP54198 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRAP54198 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRAP54198 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRAP54198 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRAP54198 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRAP54198 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRAP54198 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRAP54198 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRAP54198 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRAP54198 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRAP54198 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HIRAP54198 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HIRAP54198 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HIRAP54198 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HIRAP54198 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRAP54198 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRAP54198 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRAP54198 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRAP54198 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRAP54198 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRAP54198 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRAP54198 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRAP54198 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRAP54198 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRAP54198 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRAP54198 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HIRAP54198 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRAP54198 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRAP54198 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRAP54198 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRAP54198 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRAP54198 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HIRAP54198 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRAP54198 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRAP54198 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRAP54198 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRAP54198 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRAP54198 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRAP54198 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HIRAP54198 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRAP54198 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRAP54198 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRAP54198 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HIRAP54198 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRAP54198 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRAP54198 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRAP54198 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRAP54198 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRAP54198 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRAP54198 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRAP54198 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRAP54198 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRAP54198 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRAP54198 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRAP54198 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRAP54198 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRAP54198 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRAP54198 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRAP54198 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRAP54198 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRAP54198 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRAP54198 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRAP54198 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRAP54198 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
HIRAP54198 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRAP54198 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRAP54198 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRAP54198 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRAP54198 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRAP54198 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRAP54198 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRAP54198 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRAP54198 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRAP54198 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRAP54198 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRAP54198 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRAP54198 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms