Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP1P53367 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP1P53367 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms