Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFIP2P53365 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms