Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HK3P52790 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HK3P52790 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HK3P52790 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HK3P52790 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HK3P52790 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HK3P52790 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HK3P52790 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HK3P52790 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HK3P52790 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HK3P52790 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HK3P52790 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HK3P52790 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HK3P52790 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HK3P52790 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HK3P52790 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HK3P52790 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HK3P52790 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HK3P52790 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HK3P52790 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HK3P52790 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HK3P52790 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HK3P52790 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HK3P52790 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HK3P52790 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HK3P52790 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HK3P52790 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HK3P52790 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HK3P52790 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HK3P52790 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HK3P52790 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HK3P52790 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HK3P52790 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HK3P52790 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HK3P52790 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HK3P52790 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HK3P52790 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HK3P52790 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HK3P52790 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HK3P52790 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HK3P52790 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HK3P52790 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HK3P52790 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HK3P52790 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HK3P52790 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HK3P52790 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HK3P52790 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HK3P52790 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HK3P52790 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HK3P52790 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HK3P52790 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HK3P52790 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HK3P52790 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HK3P52790 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HK3P52790 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HK3P52790 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HK3P52790 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HK3P52790 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HK3P52790 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HK3P52790 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HK3P52790 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HK3P52790 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HK3P52790 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HK3P52790 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HK3P52790 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HK3P52790 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HK3P52790 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HK3P52790 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HK3P52790 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HK3P52790 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HK3P52790 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HK3P52790 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HK3P52790 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HK3P52790 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HK3P52790 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HK3P52790 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HK3P52790 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HK3P52790 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HK3P52790 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HK3P52790 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
HK3P52790 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HK3P52790 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HK3P52790 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HK3P52790 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HK3P52790 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HK3P52790 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HK3P52790 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HK3P52790 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HK3P52790 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HK3P52790 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HK3P52790 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HK3P52790 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HK3P52790 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HK3P52790 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HK3P52790 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HK3P52790 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HK3P52790 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HK3P52790 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HK3P52790 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HK3P52790 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms