Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
SMARCA2P51531 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SMARCA2P51531 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.13■■■■■ 4.18
SMARCA2P51531 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SMARCA2P51531 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms