Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DAP3P51398 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DAP3P51398 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DAP3P51398 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DAP3P51398 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DAP3P51398 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DAP3P51398 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DAP3P51398 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DAP3P51398 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DAP3P51398 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DAP3P51398 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DAP3P51398 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DAP3P51398 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DAP3P51398 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DAP3P51398 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DAP3P51398 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DAP3P51398 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DAP3P51398 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DAP3P51398 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DAP3P51398 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DAP3P51398 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DAP3P51398 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DAP3P51398 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DAP3P51398 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DAP3P51398 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DAP3P51398 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DAP3P51398 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DAP3P51398 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DAP3P51398 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DAP3P51398 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DAP3P51398 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DAP3P51398 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DAP3P51398 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DAP3P51398 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DAP3P51398 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DAP3P51398 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DAP3P51398 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DAP3P51398 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DAP3P51398 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DAP3P51398 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DAP3P51398 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DAP3P51398 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DAP3P51398 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DAP3P51398 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DAP3P51398 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DAP3P51398 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DAP3P51398 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DAP3P51398 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DAP3P51398 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DAP3P51398 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DAP3P51398 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DAP3P51398 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DAP3P51398 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DAP3P51398 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DAP3P51398 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DAP3P51398 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DAP3P51398 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DAP3P51398 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DAP3P51398 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DAP3P51398 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DAP3P51398 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DAP3P51398 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DAP3P51398 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DAP3P51398 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms