Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SCNN1BP51168 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCNN1BP51168 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCNN1BP51168 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms