Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB27AP51159 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB27AP51159 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms