Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRE11P49959 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRE11P49959 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRE11P49959 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRE11P49959 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRE11P49959 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRE11P49959 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRE11P49959 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MRE11P49959 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRE11P49959 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRE11P49959 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRE11P49959 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRE11P49959 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRE11P49959 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRE11P49959 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRE11P49959 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRE11P49959 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRE11P49959 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRE11P49959 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRE11P49959 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRE11P49959 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRE11P49959 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRE11P49959 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRE11P49959 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRE11P49959 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MRE11P49959 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRE11P49959 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRE11P49959 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRE11P49959 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRE11P49959 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRE11P49959 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRE11P49959 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRE11P49959 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRE11P49959 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRE11P49959 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRE11P49959 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRE11P49959 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRE11P49959 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRE11P49959 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRE11P49959 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRE11P49959 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRE11P49959 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRE11P49959 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRE11P49959 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MRE11P49959 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRE11P49959 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRE11P49959 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRE11P49959 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRE11P49959 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRE11P49959 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRE11P49959 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRE11P49959 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRE11P49959 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRE11P49959 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRE11P49959 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRE11P49959 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRE11P49959 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRE11P49959 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRE11P49959 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRE11P49959 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRE11P49959 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRE11P49959 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRE11P49959 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRE11P49959 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRE11P49959 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRE11P49959 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRE11P49959 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRE11P49959 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRE11P49959 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRE11P49959 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRE11P49959 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRE11P49959 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRE11P49959 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRE11P49959 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRE11P49959 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRE11P49959 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRE11P49959 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRE11P49959 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRE11P49959 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRE11P49959 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRE11P49959 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRE11P49959 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRE11P49959 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRE11P49959 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRE11P49959 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRE11P49959 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MRE11P49959 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRE11P49959 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRE11P49959 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRE11P49959 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRE11P49959 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRE11P49959 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRE11P49959 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRE11P49959 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRE11P49959 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRE11P49959 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRE11P49959 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRE11P49959 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRE11P49959 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRE11P49959 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms