Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSK3BP49841 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms