Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 ACSS2-210ENST00000476922 1527 ntTSL 220.06■□□□□ 0.84e-6■■■■■ 42.9
AARSP49588 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 42.9
AARSP49588 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 42.9
AARSP49588 ACSS2-215ENST00000481971 570 ntTSL 415.19■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 42.9
AARSP49588 ACSS2-212ENST00000480274 567 ntTSL 514.6□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 42.9
AARSP49588 ACSS2-209ENST00000475459 558 ntTSL 414.03□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 42.9
AARSP49588 ACSS2-217ENST00000488172 648 ntTSL 411.03□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 42.9
AARSP49588 ACSS2-214ENST00000481284 2851 ntTSL 210.76□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 42.9
AARSP49588 ACSS2-204ENST00000464399 358 ntTSL 57.42□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 42.9
AARSP49588 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 42.9
AARSP49588 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 42.9
AARSP49588 PIP5K1C-208ENST00000637724 435 ntTSL 321.93■■□□□ 1.13e-6■■■■■ 42.8
AARSP49588 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 42.6
AARSP49588 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 42.6
AARSP49588 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 42.6
AARSP49588 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 42.5
AARSP49588 PRKRIP1-206ENST00000482465 2257 ntTSL 217.1■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 42.5
AARSP49588 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 42.5
AARSP49588 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.261e-323■■■■■ 42.5
AARSP49588 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 42.5
AARSP49588 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.296e-6■■■■■ 42.5
AARSP49588 FADS1-218ENST00000544696 567 ntTSL 320.59■□□□□ 0.894e-9■■■■■ 42.4
AARSP49588 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.655e-7■■■■■ 42.1
AARSP49588 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.672e-7■■■■■ 42
AARSP49588 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.492e-7■■■■■ 42
AARSP49588 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 42
AARSP49588 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 42
AARSP49588 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 42
AARSP49588 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 42
AARSP49588 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 42
AARSP49588 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.116e-6■■■■■ 41.8
AARSP49588 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.066e-6■■■■■ 41.8
AARSP49588 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.026e-6■■■■■ 41.8
AARSP49588 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.246e-6■■■■■ 41.8
AARSP49588 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.386e-6■■■■■ 41.8
AARSP49588 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 41.8
AARSP49588 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 41.8
AARSP49588 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 41.8
AARSP49588 PPP1R21-203ENST00000416913 3208 ntTSL 216.51■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 41.8
AARSP49588 PPP1R21-205ENST00000431614 2481 ntTSL 510.45□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 41.8
AARSP49588 SSBP4-213ENST00000602088 622 ntTSL 518.12■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 41.6
AARSP49588 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.366e-6■■■■■ 41.5
AARSP49588 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.966e-6■■■■■ 41.5
AARSP49588 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.196e-6■■■■■ 41.5
AARSP49588 SSBP4-215ENST00000625926 162 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.536e-6■■■■■ 41.5
AARSP49588 PTPN12-216ENST00000523952 500 ntTSL 410.06□□□□□ -0.81e-15■■■■■ 41.5
AARSP49588 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 41.4
AARSP49588 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 41.4
AARSP49588 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 41.4
AARSP49588 LINC01169-201ENST00000558797 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 41.4
AARSP49588 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.791e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.791e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.791e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 224.63■■□□□ 1.531e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 PIN1-202ENST00000380889 1670 ntTSL 1 (best)24.24■■□□□ 1.471e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.341e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.341e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 CLN6-224ENST00000638076 2323 ntTSL 1 (best)23.27■■□□□ 1.321e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 223.01■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 222.2■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 RALA-205ENST00000468201 705 ntTSL 420.38■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 EIF4G1-237ENST00000485712 474 ntTSL 420.06■□□□□ 0.88e-11■■■■■ 41.2
AARSP49588 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 RALA-203ENST00000436179 882 ntTSL 219.36■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 ABCC10-203ENST00000372515 933 ntTSL 518.8■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 AC107871.1-201ENST00000637888 2941 ntTSL 518.77■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 DHRSX-205ENST00000444280 797 ntTSL 218.71■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 AC107871.1-203ENST00000637054 3238 ntTSL 518.6■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 CLN6-208ENST00000567060 945 ntTSL 218.01■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 ABCC10-209ENST00000502549 478 ntTSL 317.63■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 PIN1-203ENST00000585442 705 ntTSL 517.49■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 PIN1-204ENST00000586025 4022 ntTSL 216.86■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 PIN1-205ENST00000586352 755 ntTSL 316.81■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 CLN6-219ENST00000637329 1204 ntTSL 516.33■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 TSC1-206ENST00000490179 681 ntTSL 315.81■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 TSC1-205ENST00000475903 820 ntTSL 415.69■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 PIN1-208ENST00000589058 536 ntTSL 315.39■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 EIF4G1-227ENST00000455679 542 ntTSL 414.9□□□□□ -0.028e-11■■■■■ 41.2
AARSP49588 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 41.2
AARSP49588 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 41.2
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 79.9 ms