Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTAP49354 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTAP49354 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTAP49354 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTAP49354 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTAP49354 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTAP49354 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTAP49354 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTAP49354 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTAP49354 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTAP49354 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNTAP49354 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTAP49354 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTAP49354 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTAP49354 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTAP49354 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTAP49354 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNTAP49354 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FNTAP49354 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FNTAP49354 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FNTAP49354 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNTAP49354 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNTAP49354 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNTAP49354 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTAP49354 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTAP49354 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTAP49354 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTAP49354 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTAP49354 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTAP49354 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTAP49354 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTAP49354 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTAP49354 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNTAP49354 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTAP49354 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTAP49354 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTAP49354 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTAP49354 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTAP49354 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTAP49354 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTAP49354 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNTAP49354 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTAP49354 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTAP49354 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTAP49354 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTAP49354 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTAP49354 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTAP49354 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTAP49354 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTAP49354 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTAP49354 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTAP49354 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNTAP49354 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNTAP49354 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNTAP49354 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNTAP49354 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNTAP49354 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNTAP49354 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNTAP49354 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTAP49354 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTAP49354 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTAP49354 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTAP49354 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTAP49354 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTAP49354 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTAP49354 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTAP49354 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTAP49354 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTAP49354 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNTAP49354 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTAP49354 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTAP49354 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTAP49354 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTAP49354 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTAP49354 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTAP49354 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTAP49354 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTAP49354 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNTAP49354 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FNTAP49354 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNTAP49354 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNTAP49354 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNTAP49354 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNTAP49354 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms