Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLMP48507 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLMP48507 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLMP48507 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLMP48507 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLMP48507 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLMP48507 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLMP48507 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLMP48507 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLMP48507 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLMP48507 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLMP48507 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLMP48507 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCLMP48507 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLMP48507 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLMP48507 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLMP48507 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLMP48507 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLMP48507 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLMP48507 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLMP48507 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLMP48507 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLMP48507 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLMP48507 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLMP48507 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLMP48507 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLMP48507 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLMP48507 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLMP48507 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLMP48507 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLMP48507 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLMP48507 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLMP48507 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLMP48507 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLMP48507 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLMP48507 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLMP48507 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLMP48507 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLMP48507 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLMP48507 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLMP48507 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLMP48507 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLMP48507 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLMP48507 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLMP48507 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLMP48507 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLMP48507 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLMP48507 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLMP48507 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLMP48507 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLMP48507 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLMP48507 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLMP48507 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLMP48507 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLMP48507 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLMP48507 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLMP48507 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLMP48507 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLMP48507 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLMP48507 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLMP48507 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLMP48507 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLMP48507 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLMP48507 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLMP48507 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLMP48507 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLMP48507 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLMP48507 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLMP48507 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLMP48507 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLMP48507 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLMP48507 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLMP48507 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLMP48507 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLMP48507 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLMP48507 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLMP48507 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLMP48507 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLMP48507 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLMP48507 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLMP48507 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLMP48507 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLMP48507 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLMP48507 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLMP48507 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLMP48507 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLMP48507 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLMP48507 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLMP48507 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLMP48507 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLMP48507 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLMP48507 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLMP48507 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLMP48507 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLMP48507 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLMP48507 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLMP48507 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLMP48507 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLMP48507 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLMP48507 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms