Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARCN1P48444 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARCN1P48444 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARCN1P48444 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms