Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB2P47870 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRB2P47870 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRB2P47870 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms