Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABIFP47224 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABIFP47224 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RABIFP47224 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABIFP47224 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABIFP47224 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABIFP47224 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABIFP47224 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABIFP47224 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RABIFP47224 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RABIFP47224 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RABIFP47224 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABIFP47224 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABIFP47224 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RABIFP47224 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABIFP47224 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABIFP47224 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RABIFP47224 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABIFP47224 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABIFP47224 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABIFP47224 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABIFP47224 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABIFP47224 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABIFP47224 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABIFP47224 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABIFP47224 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABIFP47224 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABIFP47224 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABIFP47224 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RABIFP47224 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABIFP47224 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABIFP47224 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABIFP47224 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABIFP47224 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABIFP47224 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABIFP47224 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABIFP47224 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABIFP47224 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABIFP47224 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABIFP47224 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABIFP47224 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RABIFP47224 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABIFP47224 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABIFP47224 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABIFP47224 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABIFP47224 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABIFP47224 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABIFP47224 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABIFP47224 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RABIFP47224 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABIFP47224 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABIFP47224 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABIFP47224 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABIFP47224 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABIFP47224 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RABIFP47224 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RABIFP47224 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RABIFP47224 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABIFP47224 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABIFP47224 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABIFP47224 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABIFP47224 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABIFP47224 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABIFP47224 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABIFP47224 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABIFP47224 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABIFP47224 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABIFP47224 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RABIFP47224 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABIFP47224 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABIFP47224 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABIFP47224 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABIFP47224 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABIFP47224 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABIFP47224 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABIFP47224 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABIFP47224 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABIFP47224 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RABIFP47224 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABIFP47224 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABIFP47224 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RABIFP47224 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABIFP47224 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RABIFP47224 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABIFP47224 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABIFP47224 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABIFP47224 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms