Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCC3P46736 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCC3P46736 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms