Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XCR1P46094 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XCR1P46094 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XCR1P46094 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XCR1P46094 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XCR1P46094 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XCR1P46094 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XCR1P46094 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XCR1P46094 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XCR1P46094 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XCR1P46094 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XCR1P46094 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XCR1P46094 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XCR1P46094 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XCR1P46094 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XCR1P46094 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XCR1P46094 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XCR1P46094 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XCR1P46094 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XCR1P46094 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XCR1P46094 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XCR1P46094 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XCR1P46094 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XCR1P46094 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XCR1P46094 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XCR1P46094 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XCR1P46094 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XCR1P46094 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
XCR1P46094 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XCR1P46094 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XCR1P46094 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XCR1P46094 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XCR1P46094 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XCR1P46094 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
XCR1P46094 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XCR1P46094 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XCR1P46094 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XCR1P46094 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XCR1P46094 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XCR1P46094 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XCR1P46094 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XCR1P46094 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XCR1P46094 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XCR1P46094 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XCR1P46094 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XCR1P46094 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XCR1P46094 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XCR1P46094 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XCR1P46094 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XCR1P46094 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XCR1P46094 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XCR1P46094 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XCR1P46094 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XCR1P46094 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XCR1P46094 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XCR1P46094 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XCR1P46094 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XCR1P46094 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XCR1P46094 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
XCR1P46094 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XCR1P46094 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XCR1P46094 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XCR1P46094 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XCR1P46094 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XCR1P46094 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XCR1P46094 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XCR1P46094 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XCR1P46094 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XCR1P46094 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XCR1P46094 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XCR1P46094 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XCR1P46094 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XCR1P46094 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XCR1P46094 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XCR1P46094 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XCR1P46094 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XCR1P46094 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XCR1P46094 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XCR1P46094 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XCR1P46094 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XCR1P46094 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XCR1P46094 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XCR1P46094 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XCR1P46094 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XCR1P46094 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XCR1P46094 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XCR1P46094 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XCR1P46094 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XCR1P46094 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XCR1P46094 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XCR1P46094 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XCR1P46094 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XCR1P46094 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms